Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIT1Q9Y2X7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms