Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms