Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms