Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNK4Q9NYG8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms