Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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HOXC10Q9NYD6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC10Q9NYD6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HOXC10Q9NYD6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HOXC10Q9NYD6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HOXC10Q9NYD6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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HOXC10Q9NYD6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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HOXC10Q9NYD6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXC10Q9NYD6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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