Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms