Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLSPNQ9HAW4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms