Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZCCHC2Q9C0B9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms