Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPATA9Q9BWV2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPATA9Q9BWV2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPATA9Q9BWV2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPATA9Q9BWV2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPATA9Q9BWV2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms