Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM79Q9BSE2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM79Q9BSE2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms