Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USB1Q9BQ65 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms