Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms