Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85AQ96PX6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85AQ96PX6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms