Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms