Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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RABGGTAQ92696 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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RABGGTAQ92696 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RABGGTAQ92696 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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