Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PALLDQ8WX93 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PALLDQ8WX93 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms