Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WDR53Q7Z5U6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms