Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BEND4Q6ZU67 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms