Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms