Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA3EQ6PEY2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TUBA3EQ6PEY2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms