Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD54Q6NXT1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms