Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNS3Q68CZ2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNS3Q68CZ2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms