Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM208BQ5VWN6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM208BQ5VWN6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms