Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms