Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC25A52Q3SY17 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC25A52Q3SY17 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms