Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms