Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CHD4Q14839 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHD4Q14839 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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