Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SPIDRQ14159 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIDRQ14159 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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