Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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