Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLAMF1Q13291 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms