Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PRKAA1Q13131 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PRKAA1Q13131 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PRKAA1Q13131 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PRKAA1Q13131 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PRKAA1Q13131 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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PRKAA1Q13131 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRKAA1Q13131 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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