Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBXN1Q04323 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms