Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms