Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms