Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPS3AP61247 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms