Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms