Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TPD52P55327 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TPD52P55327 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TPD52P55327 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52P55327 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms