Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms