Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms