Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms