Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ARHGEF38-IT1-201ENST00000512262 456 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC090531.1-201ENST00000547168 923 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LACRT-203ENST00000547511 504 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL354809.1-201ENST00000618106 716 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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