Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC9P31274 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC9P31274 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms