Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms