Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5AP29375 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms