Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLD1P28340 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLD1P28340 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLD1P28340 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLD1P28340 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLD1P28340 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms