Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms