Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPCAMP16422 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms