Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPCP11686 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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