Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC166P0CW27 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms