Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms